Предприниматель и его брат находятся в международном розыске. В 2009 г. Исмаилов столкнулся с масштабными претензиями со стороны правоохранительных органов к деятельности Черкизовского рынка в Москве — рынок был закрыт, а Исмаилов покинул страну. В 2017 г. его признали банкротом предъявили обвинения в убийстве и незаконном обороте оружия. Суд арестовал его заочно. В августе 2019 г. прокуратура Швейцарии арестовала счета Исмаилова по обвинению в мошенничестве с кредитными средствами. Следствие считает Исмаилова организатором убийств двух бизнесменов. Их исполнитель Мехман Керимов осужден на 13 лет колонии строгого режима.

